中國科學院新疆生態與地理研究所生物標本館是在50年代新疆綜合科學考察的基礎上建立的，自1956年中國科學院新疆分院成立，即開始以新疆為代表的中國內陸干旱區生物、土壤標本進行采集、館藏，迄今已有近50年的歷史，包括植物、動物、微生物、土壤、沙樣等多方面內容，現已積累館藏各類標本約12萬號，館藏各類標本數量為：植物：約10萬余份；動物：約5200份；微生物：約2000份；土壤斷面(整段)標本140余號、盒裝(剖面)標本1000余號；母巖新生體、侵入體及其它土壤形成物和供測試、分析用標本若干；各類沙樣及巖石、化石、出土文物等標本近2000余號。成為我國西北地區館藏種類、數量最多的綜合性標本館之一，在國際、國內均具有典型的區域代表性。在館藏的標本中，還有近千號模式標本和許多單型科、屬及少型科、屬標本；此外還包括特有物種、國家級重點保護珍稀瀕危物種近200種。先后發表有關專著33部，論文70多篇；有關成果獲獎40多項。
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幾十年來，館藏標本對有關志書、專著、論文的編寫，提供了豐富、詳實的依據，例如《中國植物志》、《中國藥典》、《中國稀有瀕危植物紅皮書》、《新疆植物名錄》、《新疆藥用植物志》、《新疆植物志》、《新疆沙漠植物志》、《中國土壤分類》、《荒漠堿土》、《新疆通志》等等，并為一大批國家和地方重大、重點科研項目、各類科學考察、新疆各自然保護區規劃和建設等，提供了科學咨詢和科學依據。
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1995年中國科學院考慮研究所的方向和任務，撥專款支持建成新館，但內部未做任何裝修，多是大框架結構，總面積4397.8m2(四層建筑)。 中國科學院實施知識創新工程試點對院屬標本館的建設給予了極大支持，中國科學院新疆生態與地理研究所生物標本館在院撥專項經費的支持下，通過改造裝修、增添儀器設備，標本館面貌大為改觀。
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隨著現代社會向信息化、數字化方向的邁進, 中國科學院新疆生態與地理研究所生物標本館，充分利用中國科學院專項經費的支持，正在加大力度開展館藏各類標本條碼化管理和信息數據錄入的工作。標本館管理的科學化、網絡化、數字化進程，將使中國科學院新疆生態與地理研究所生物標本館的管理逐步達到國家先進水平的行列，它將有利于發揮該標本館在中國干旱區乃至中亞地區生物多樣性研究的功能，使標本館能更好地為科學研究和國家經濟建設服務。
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標本館先后接待了美國、日本、加拿大、俄羅斯、泰國、巴基斯坦等十多個國家的外賓，還利用館藏標本與國內科研單位與高校交換標本。并通過開放日活動，接待來訪參觀，累計數萬人次，為高等學校學生實習，中小學生科普教育提供了條件，宣傳了新疆的資源、環境，增進了“愛我中華、愛我新疆”，取得了重要社會效益。1998年以來，該標本館先后獲國家、新疆維吾爾自治區、烏魯木齊市科普教育基地和青少年科技教育基地命名，并被新疆維吾爾自治區黨委組織部確定為干部輪訓教育點。
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烏魯木齊北京南路40附3號
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